长期不经营的公司若未及时办理注销手续，将会面临诸多法律风险和经济损失。具体而言，可能出现以下情况：

1. **行政处罚**：依据现行公司法规，企业成立后若连续六个月未开展经营活动，或经营中断超过六个月，工商管理部门有权撤销其营业执照。同时，未履行注销程序的企业还将面临其他行政处罚。

长期闲置的企业若未及时办理注销手续，将会面临一系列严重后果。首先，工商管理部门有权对连续六个月未开展经营活动且无正当理由的企业，依法吊销其营业执照。其次，长期进行零申报的企业将被税务机关列入重点监控名单，这将严重影响企业的信用评级。更为严重的是，被吊销营业执照的企业必须在15个工作日内完成税务清算，不仅要补缴所有欠缴税款，还将面临相应的行政处罚。

长期未开展业务且未办理注销手续的企业，可能会被市场监管部门纳入经营异常名录，甚至被列入严重违法失信企业名单。这不仅会损害企业的商业信誉，还可能对法定代表人产生连带影响，使其在后续的商业合作、金融借贷等方面受到限制。在税务方面，即便企业处于停业状态，仍需依法履行纳税申报义务。若长期拖欠税款或未及时申报，税务机关可依法采取罚款、加收滞纳金等惩戒措施。

未按时完成税务申报或存在欠缴税款的情况，将面临滞纳金和罚款的处罚，同时可能被纳入税务异常名录，对法人代表及相关责任人的信用记录造成不良影响。在工商管理方面：若企业长期未办理注销手续，其营业执照将被市场监管部门列入经营异常名录，这将严重损害企业的商业信誉。此外，该企业后续办理工商登记、设立新公司等业务时也会受到相应限制。对个人而言：企业法定代表人及主要负责人的个人征信将受到影响，可能导致其在申请贷款、乘坐高铁飞机等日常事务中受到限制。