从法律层面来看，企业通过移动支付平台发放工资本身并不违法。关键在于企业是否履行了相应的纳税义务。若企业已按规定完成个人所得税的代扣代缴及申报工作，这种发放方式是完全合规的。反之，若企业利用移动支付渠道逃避个税申报和缴纳，则涉嫌偷税漏税，属于违法行为。

从法律角度分析，这种行为涉嫌违法，很可能存在偷逃税款的问题，建议向税务部门进行举报。若支付宝转账记录中明确标注为"工资"字样，且转账方为公司管理层或财务人员，经过相关调查核实后，这些转账记录可以作为证明雇佣关系的辅助证据。但需要特别注意的是，企业主通过个人账户发放工资这一行为本身，并不能直接确立劳动关系。要证明劳动关系的存在，需要提供更具说服力的证据，比如加盖公章的工作证件、工牌等。

企业通过第三方支付平台发放员工薪酬并不违反现行法规，但需注意以下合规要点：

1. 税务申报义务

企业必须依法完成税务登记，并按时进行纳税申报。采用电子支付方式发放薪酬时，仍需按照实际发放金额如实申报个人所得税及其他相关税费。

2. 合规风险提示

若企业存在以下情形可能面临税务违法风险：

- 未按规定进行全员全额扣缴申报

- 通过拆分支付等方式规避代扣代缴义务

- 未妥善保存完整的薪酬支付凭证

3. 法律依据

根据《税收征收管理法》相关规定：

- 第十五条明确纳税人应当依法办理税务登记

- 第二十五条要求纳税人必须如实办理纳税申报

- 第六十三条对偷税行为规定了相应罚则

建议企业在采用新型支付方式时，应当同步完善财务核算和税务管理流程，确保薪酬发放全流程合法合规。

工资支付方式的合法性分析：

1. 协商支付方式

用人单位与劳动者通过协商一致，可以采用微信或支付宝等电子支付方式发放工资。这种支付方式本身并不违反劳动法规定。

2. 潜在法律风险

实际操作中需注意以下风险：

- 电子支付记录可能被误删或丢失

- 支付平台数据保存期限有限

- 支付备注信息可能不够明确

3. 电子证据效力

根据相关法律规定：

- 微信、支付宝转账记录属于合法电子证据

- 需要确保记录完整、可追溯

- 必要时需支付平台出具相关证明

4. 注意事项

建议用人单位：

- 保留完整的工资支付凭证

- 在转账时注明"工资"等明确用途

- 定期与劳动者核对工资发放情况

5. 补充建议

为规避风险，建议同时保留：

- 工资条等书面凭证

- 双方确认的工资发放协议

- 其他辅助证明材料

（注：具体操作应咨询专业法律人士）